抄録
カキ（Diospyros kaki Thunb.）は果実の脱渋性の違いによって 4 つのタイプに分類されるが，そのうち完全甘ガキ（PCNAタイプ）のみが樹上で安定して脱渋する．PCNA タイプはその他のタイプ（non-PCNA タイプ）に対して遺伝的に劣性であり，また，この形質は polysomic な遺伝様式を示す一つの遺伝子（AST 遺伝子）に支配されているとされている．これまでに AST 遺伝子座に連鎖している 2 つの RFLP マーカー（A1 と A2）が単離されており，PCNA タイプのマーカー選抜に有効であることが示されている．本研究は，これらの RFLP マーカーを PCR マーカーに変換することを目的として行った．まず，2 つの RFLP マーカーに対応した領域を inverse PCR によって単離した．各領域の塩基配列に基づき 2 種類のプライマーセット（E4/E9r と E4/A2r）を設計したところ，RFLP マーカーに対応した 2 つの SCAR（sequence characterized amplified region）マーカー（PCR-A1 と PCR-A2）を検出することが可能となった．‘西村早生’由来の戻し交雑集団における 2 種類の SCAR マーカーの分離は，それぞれ対応する RFLP マーカーと完全に一致していた．また，‘会津身不知’由来の戻し交雑集団 FU-275 では PCR-A2 は検出されなかったが，供試した non-PCNA 個体の全てで PCR-A1 が検出された．したがって，これらの集団では SCAR マーカーによって PCNA タイプと non-PCNA タイプの識別が可能であることが示された．一方，‘黒熊’の後代である KU-325 において，マーカー領域と AST 遺伝子座との連鎖関係が崩れている個体が確認され，‘黒熊’由来の交雑集団では，今回開発したマーカーは有効でないことが示された．これらの SCAR マーカーを利用した遺伝解析の可能性について考察した．
