2019 年 2019 巻 2 号 p. 57-62
センチュウ抵抗性ダイズ品種「スズマルR」と反復親の「スズマル」の遺伝的背景の同質性確認のため,全ゲノムリシーケンスを行い,塩基配列を比較した.その結果,「スズマルR」に残存する「スズマル」以外のゲノム断片は,シストセンチュウ抵抗性遺伝子を含む3 箇所と,第5 染色体末端の3.6 Mb の小さな断片のみであることがわかった.第5 染色体の断片は,当初導入が試みられていたダイズわい化病抵抗性遺伝子(Rsdv1)領域に近接していた.この断片は,選抜の最終段階で不良形質発現のためRsdv1 を「スズマル」型に戻した際に近隣領域に残った導入断片であると考えら れた.本研究により,全ゲノムシーケンスによる配列比較により「スズマル」と「スズマルR」の遺伝的背景の高い同質性を明らかにした.全ゲノムリシーケンス解析は,遺伝的背景を詳細に比較可能にする強力なツールであり,DNA マーカーでは検出が困難な小さな導入断片まで特定することで,より精密なピンポイント育種に貢献できると考えられる.