生物物理

巻頭言

生物学と化学の融合

吉川信也

2005 年 45 巻 2 号 p. 63
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.63

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解説

ネコの宙返りと形空間のリーマン幾何学 ―分子の構造転移運動への応用―

柳尾朋洋

2005 年 45 巻 2 号 p. 66-71
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.66

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The so-called “falling cat” problem, which is concerned with the coupling between internal motions and rotations of a flexible body, is introduced. I give a geometric interpretation of the Eckart condition, which is frequently used for the approximate separation of rotations and internal motions of polyatomic molecules. It is shown that the separation procedure based on the Eckart condition disregards the intrinsically “curved” nature of molecular internal space (shape space). The “curved” nature of shape space is shown to have considerable effects on structural transition dynamics of polyatomic molecules.

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総説

ミオシンホスファターゼ阻害タンパク質 CPI-17の構造と機能

大木進野, 江藤真澄, 松澤史子, 甲斐荘正恒

2005 年 45 巻 2 号 p. 72-77
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.72

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Cell motility, including smooth muscle contraction and cell migration, is regulated by reversible phosphorylation of myosin. Recent studies have shown that myosin phosphatase (MP), along with kinases, contributes dynamically to the regulation of myosin-II phosphorylation. An MP specific inhibitor named CPI-17, which is expressed in smooth muscle and neuronal cells, mediates receptor signaling leading to myosin-II phosphorylation. In this review, we discuss structure/function relationships of CPI-17 stemming from our recent NMR studies and computer modeling results. The combination of biophysical approaches with biochemical techniques has revealed the inhibitory mechanism of CPI-17.

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プチダレドキシン結合による P450camの酸素添加反応の制御機構

当舎武彦, 石森浩一郎, 森島績

2005 年 45 巻 2 号 p. 78-83
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.78

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Structural changes in cytochrome P450 camphor monooxygenase (P450cam) upon the binding of the electron donor, putidaredoxin (Pdx), have been believed to be crucial for the P450cam catalysis. However, the regulation mechanism for the P450cam-catalyzed reaction by Pdx binding, so-called “effector function” of Pdx, was unclear due to the lack of the structural information on the Pdx-induced structural changes in P450cam. Here we summarize the recent progress in characterizing the Pdx-induced structural changes in P450cam by using NMR spectroscopy and site-directed mutagenesis. The current information would help us to understand the effector function of Pdx in the P450cam catalysis.

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Redoxセンサータンパク質，ヘム制御ホスホジエスエラーゼの構造と機能

黒河博文, 吉村-鈴木登紀子, 笹倉由貴江, 渡部美紀, 平田智士, 田口須恵, 五十嵐城太郎, 佐上郁子, 清水透

2005 年 45 巻 2 号 p. 84-89
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.84

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電子付録

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Heme-regulated phosphodiesterase from Escherichia coli (Ec DOS) is a novel PAS heme-sensor enzyme. Ec DOS is active in the Fe²⁺ heme-bound form, whereas it is inactive in the Fe³⁺ heme-bound form. To elucidate the mechanism of the redox-dependent heme-regulated catalysis, we examined spectroscopic and functional characters of site-directed and deletion mutant proteins. We also determined crystal structures of the wild type enzyme under various conditions. In this review, we summarized findings about heme-sensor proteins, PAS domain and phosphodiesterase in general and structure and function relationships of Ec DOS specifically.

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トピックス

受容体サブユニットの配置変換がシグナル伝達を仲介する

立山充博, 久保義弘

2005 年 45 巻 2 号 p. 90-93
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.90

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膜小胞が有する多彩なトポロジー変換能

野村典正, 稲葉岳彦, 滝口金吾

2005 年 45 巻 2 号 p. 94-96
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.94

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電子付録

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超好熱菌由来アルドラーゼのユニークな4次構造と高度耐熱性

櫻庭春彦, 大島敏久, 津下英明, 勝沼信彦

2005 年 45 巻 2 号 p. 97-100
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.97

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RalとSec5 Ral結合ドメイン複合体の結晶構造解析

深井周也, Brunger Axel T.

2005 年 45 巻 2 号 p. 101-104
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.101

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理論/実験技術

広域走査型プローブ顕微鏡の開発と細胞生物学への応用

水谷武臣, 芳賀永, 川端和重

2005 年 45 巻 2 号 p. 105-108
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.105

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談話室

日本学会事務センター破算に思う

有坂文雄

2005 年 45 巻 2 号 p. 109-113
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.109

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用語コラム

用語コラム 1

2005 年 45 巻 2 号 p. 71
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.71

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用語コラム 2

2005 年 45 巻 2 号 p. 83
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.83

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用語コラム 3

2005 年 45 巻 2 号 p. 108
発行日: 2005年
公開日: 2005/03/25

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.45.108

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