生物物理

巻頭言

生物物理学が拓く未来

三宅淳

原稿種別: 研究論文
専門分野: 情報学
2002 年42 巻4 号 p. 153
発行日: 2002年
公開日: 2002/07/24

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.42.153

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解説

キネシン分子モーターの仕組み

川口憲治, 上村想太郎, 石渡信一

原稿種別: 研究論文
専門分野: 情報学
2002 年42 巻4 号 p. 156-161
発行日: 2002年
公開日: 2002/07/24

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.42.156

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Kinesin motors are mechano-enzymes that hydrolyze ATP to generate force and directional movement along a microtubule. Nucleotide-dependent conformational changes of the head and neck region of kinesin have been shown by cryoelectron microscopy and spectroscopic techniques. Single molecule analysis supports key predictions of the hand-over-hand model for motility of dimeric conventional kinesin, whereas the discovery of a processive one-headed kinesin strongly supports the biased Brownian ratchet model. In this short review, we summarize the present status of research on the mechanism of kinesin motility.

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結晶構造解析によるイエロープロテインの光反応モデルとその問題点

清水伸隆, 今元泰, 片岡幹雄

原稿種別: 研究論文
専門分野: 情報学
2002 年42 巻4 号 p. 162-167
発行日: 2002年
公開日: 2002/07/24

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.42.162

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The reaction mechanism of photoactive yellow protein (PYP) has been proposed based on the high-resolution x-ray crystal structure models of the photocycle intermediates. After the analysis, infrared and UV/Visible spectroscopic studies have been carried out on the intermediates in wild-type and mutated PYP. However, the data from the spectroscopic studies are not consistent with the proposed structural models and the reaction mechanism. Here, we describe the conflicts between the crystallographic and spectroscopic studies and discuss the reaction mechanism of PYP in solution.

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総説

目覚まし時計の分子生物学：カイコの胚子発育を再開させるタイマータンパク質

甲斐英則

原稿種別: 研究論文
専門分野: 情報学
2002 年42 巻4 号 p. 168-173
発行日: 2002年
公開日: 2002/07/24

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.42.168

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A model is proposed that an ATPase called EA4 measures time for an active resumption of embryonic development at the end of Bombyx diapause. The timer function of EA4 comprises a built-in mechanism in the EA4 protein structure and it may undergo a series of conformational changes with time. The carbohydrate moiety of EA4 regulates the time measurement through its interaction with a peptide named PIN. PIN forms an equimolar complex with EA4 and presumably inhibits the conformational change of EA4 to hold the timer. Winter cold is a possible external time cue that induces the dissociation of the complex, which in turn results in the timer activation of EA4. We refer to EA4 as a time interval measuring enzyme, TIME.

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ドメイン下層のタンパク質階層性

－プロテインGとGペプチドのフォールディング研究から－

本田真也

原稿種別: 研究論文
専門分野: 情報学
2002 年42 巻4 号 p. 174-178
発行日: 2002年
公開日: 2002/07/24

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.42.174

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Hierarchical folding is still an attractive model to describe the mechanism of immediate decrease in chain-entropy of unfolded proteins, and to describe the molecular behavior implied in the funnel model. To provide an insight into this hierarchical folding mechanism, we are advancing the molecular dissection analysis of a single domain protein, protein G. In this review, we introduce our approach and summarize the findings of the structural hierarchy of proteins inside a domain.

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DNAの高次構造スイッチングと遺伝子発現

吉川祐子, 湊元幹太, 吉川研一

原稿種別: 研究論文
専門分野: 情報学
2002 年42 巻4 号 p. 179-184
発行日: 2002年
公開日: 2002/07/24

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.42.179

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Long DNA molecules above the size of several tens kbp undergo marked discrete transition on their higher-order structure. Recent study on single molecular chain observation indicates that the structural transition of DNA induces discrete ON/OFF switching on transcriptional activity. Changes of environmental parameters induce the morphological variation in folded DNA. We propose a hypothesis that appearance of partially unfolded part on chromatin may concern with the promotion of gene expression.

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トピックス

超好熱菌由来タンパク質の準安定構造とネイティブ構造への転移－熱成熟とよばれる現象

白木賢太郎, 高木昌宏, 今中忠行

原稿種別: 研究論文
専門分野: 情報学
2002 年42 巻4 号 p. 185-188
発行日: 2002年
公開日: 2002/07/24

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.42.185

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談話室

第14回生物物理国際会議（XIV IUPAB Congress）報告

永山國昭

原稿種別: 研究論文
専門分野: 情報学
2002 年42 巻4 号 p. 189-192
発行日: 2002年
公開日: 2002/07/24

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.42.189

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生物物理学会員の科研費申請の窓口が広がりました！

津田基之

原稿種別: 研究論文
専門分野: 情報学
2002 年42 巻4 号 p. 193
発行日: 2002年
公開日: 2002/07/24

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.42.193

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