巻号一覧
53 巻, 1 号
通巻305号
選択された号の論文の25件中1～25を表示しています
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巻頭言
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難波 啓一2013 年 53 巻 1 号 p. 001
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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解説
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前島 一博, 城地 保昌, 西野 吉則, 高田 英昭, 鎌田 福美, 日原 さえら2013 年 53 巻 1 号 p. 004-010
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
ジャーナル フリーHow is 2-m-long genomic DNA organized into a mitotic chromosome or nucleus? The nucleosome fiber has long been assumed to be folded into a 30-nm chromatin fiber, and further helically folded larger fiber. However, when we observed frozen hydrated human mitotic cells using cryoelectron microscopy (cryo-EM), no higher-order structures including 30-nm chromatin fibers were found. To further investigate the bulk structure of mitotic chromosomes, we performed small-angle X-ray scattering (SAXS) at SPring-8. No structural feature larger than 11 nm was detected, even on a chromosome-diameter scale (~1 μm). We also found a similar scattering pattern in interphase nuclei of HeLa cells in the range up to ~275 nm. Our findings suggest a common structural feature in interphase and mitotic chromatins: compact and irregular folding of nucleosome fibers occurs without a 30-nm chromatin structure.
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総説
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野口 博司2013 年 53 巻 1 号 p. 011-014
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
ジャーナル フリー
電子付録Coarse-grained simulation methods for lipid membranes are reviewed. In particular, a meshless model and a highly simplified molecular model are explained with a few application examples: membrane self-assembly and micelle formation. When a vesicle composed of lipid and detergent types of molecules is ruptured, a disk-shaped micelle, the bicelle, is typically formed. Cup-shaped vesicles and octopus-like micelles are also formed depending on the surfactant ratio and critical micelle concentration.
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御手洗 菜美子2013 年 53 巻 1 号 p. 015-019
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
ジャーナル フリーMessenger RNAs (mRNA), that code sequences of amino acids by using triplets of nucleotides (codons), are translated by multiple ribosomes. Usually more than one codon corresponds to an amino acid. The ribosome speed is known to dependent on the codon, thus there is a room to keep an amino acid sequence (protein) and change the ribosome speed. We model the ribosome traffic with codon-dependent rate estimated for E. coli and show that some wild type codon sequences can regulate “traffic jam” by placing slow codons at the begging of the mRNA. We discuss possible roles of slow codons in translation process.
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今村 博臣, 安東 友美, 藤川 誠2013 年 53 巻 1 号 p. 020-023
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
ジャーナル フリーATP is indispensable for all living organisms. Despite its importance, however, distribution and dynamics of ATP level inside living cells still remained unclear. We have developed FRET-based ATP biosensors, “ATeam” and “GO-ATeam”, which enabled us to visualize intracellular ATP level. Using these biosensors, we have successfully evaluated the effect of IF1 protein and Ca2+ on regulation of ATP level. Also, we found that replication of hepatitis C virus genome resulted in the declination of cytosolic ATP level of host cells and the formation of putative virus replication sites with high ATP levels.
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齋藤 香織, 福島 和彦2013 年 53 巻 1 号 p. 024-027
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
ジャーナル フリーTime-of-flight secondary ion mass spectrometry (TOF-SIMS) is a non-destructive technique that allows for direct imaging of molecular ions with high spatial resolution on sample surface. In this review, the application of TOF-SIMS imaging at the cellular level in the investigation of wood chemical components including lignin is described.
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山田 和弘2013 年 53 巻 1 号 p. 028-031
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
ジャーナル フリーWe have solved the crystal structures of the yeast chromatin remodeling factor ISW1a (ΔATPase) complex with and without bound duplex DNA at resolutions of 3.60 and 3.25 Å, respectively. The DNA-bound form reveals the characteristic feature of each protein component of ISW1a (HSS and Ioc3) individually gripping a DNA molecule. In addition to these X-ray structures, we have performed Cryo-EM analyses of ISW1a-nucleosome complex, and a biochemical analysis of the remodeling action of ISW1a using a di-nucleosome as substrate. Based on the composite analysis we can elucidate the remodeling mechanism of ISW1a for two nucleosomes in atomic detail.
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トピックス
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矢木 真穂2013 年 53 巻 1 号 p. 032-033
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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森住 威文2013 年 53 巻 1 号 p. 034-036
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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新田 高洋2013 年 53 巻 1 号 p. 037-038
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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理論/実験 技術
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中島 真人, 牛木 辰男2013 年 53 巻 1 号 p. 040-043
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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談話室
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中村 春木2013 年 53 巻 1 号 p. 044-046
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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最先端光計測とライフサイエンスの近未来―バイオ・ラマン2017研究会報告盛田 伸一, 伊藤 民武2013 年 53 巻 1 号 p. 047-048
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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支部だより
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中部支部活動報告2013 年 53 巻 1 号 p. 049-050
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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若手の声
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夏の学校「トランスレーション」報告／博士後期課程からの就職活動2013 年 53 巻 1 号 p. 051-052
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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海外だより
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～楽しい研究室への道のり～2013 年 53 巻 1 号 p. 053-054
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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用語解説
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2013 年 53 巻 1 号 p. 014
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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2013 年 53 巻 1 号 p. 019
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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2013 年 53 巻 1 号 p. 036
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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2013 年 53 巻 1 号 p. 039
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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2013 年 53 巻 1 号 p. 046
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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書評
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2013 年 53 巻 1 号 p. 050
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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2013 年 53 巻 1 号 p. 055_1
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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2013 年 53 巻 1 号 p. 055_2
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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2013 年 53 巻 1 号 p. 056
発行日: 2013年
公開日: 2013/01/29
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