生物物理

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Online ISSN : 1347-4219
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46 巻, supplement2 号

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2P415 Probing for hydrophobic molecules in cavities and clefts of a protein by the 3D-RISM theory(46. Water and bio-molecule,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Ryusuke Hiraoka, Takashi Imai, Andriy Kovalenko, Tomoyoshi Seto, Fumio ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S399-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S399_3

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2P416 Role of Collapse of Hydrophobic Cluster Residues in Protein Folding(46. Water and bio-molecule,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Hiroki Matsumoto, Ismail E. Rozi, Yasutaka Seki, Kunitsugu Soda

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S399-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S399_4

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2P417 Prediction of hydrogen-bonding sites between Protein and Ligand by Molecular Dynamics Simulation(46. Water and bio-molecule,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Katsumi Murata, Naoya Nagata, Isao Nakanishi, Kazuo Kitaura

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S400-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S400_1

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2P418 Hydrophilic and hydrophobic effects on the function of an allosteric protein in solution(46. Water and bio-molecule,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Antonio Tsuneshige, Takehiko Haga

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S400-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S400_2

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2P419 Calorimetric titration study of F-actin solution with potassium chloride(46. Water and bio-molecule,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Hideyuki Komatsu, Ying Gan Xin, Takashi Miyazaki, Akinori Sarai, Makot ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S400-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S400_3

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2P420 Two-colored emission from an intermediate M_<420> of firefly luciferin in deoxygenated DMSO under some content rates of water and t-BuOK(46. Water and bio-molecule,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Rikuo Shibata, Yasuhiko Yoshida, Naohisa Wada

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S400-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S400_4

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2P421 Cellular States of Dried Polypedirum Vanderplanki as Studied by Temperature-Controlled Fourier Transform Infrared Spectroscopy(46. Water and bio-molecule,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Takao Furuki, Minoru Sakurai, Ken-ichi Akao, Masahiko Watanabe, Takahi ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S401-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S401_1

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2P422 Sequence Context Dependent Flexibility of DNA Studied by Molecular Dynamics Simulation(46. Water and bio-molecule,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Satoshi Fujii, Hidetoshi Kono, Shigenori Takenaka, Nobuhiro Go, Akinor ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S401-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S401_2

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2P423 Competition Between Protein Ligands and Cytoplasmic Inorganic Anions for the Metal Cation(46. Water and bio-molecule,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Carmay Lim, Todor Dudev

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S401-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S401_3

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2P424 Prebiotic oligomerization of amino acids under the non-equilibrium hydrothermal environments(47. Origin and evolution of life,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Eiichi Imai, Hajime Honda

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S401-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S401_4

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2P425 Adaptation dynamics for high temperature and heat tolerant evolution of Escherichia coli(47. Origin and evolution of life,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Masato Okubo, Akiko Kashiwagi, Toshihiko Kishimoto, Tetsuya Yomo

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S402-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S402_1

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2P426 Phenotypic Noise, Error Catastrophe, and Genetic Evolution(47. Origin and evolution of life,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Kunihiko Kaneko

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S402-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S402_2

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2P427 Simulating evolution and development in animal body plan(47. Origin and evolution of life,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Koichi Fujimoto, Shuji Ishihara, Kunihiko Kaneko

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S402-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S402_3

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2P428 Mind Time and Space as a Dynamical System(47. Origin and evolution of life,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Kazuto Sasai, Yukio Gunji

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S402-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S402_4

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2P429 The game of mandates : network structure of knowledge and decision making(47. Origin and evolution of life,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Asaki Nishikawa

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S403-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S403_1

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2P430 Structural change of a dynamical system derived from mixture of two limits(47. Origin and evolution of life,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Moto Kamiura, Yukio P. Gunji

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S403-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S403_2

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2P431 Motion perception and Perceptual filling-in at the blind spot(47. Origin and evolution of life,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Shimpei Tatsumi, Yukio P Gunji

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S403-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S403_3

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2P432 A novel statistical prediction method for multiple protein-protein interaction interfaces(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Wataru Nemoto, Hiroyuki Toh

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S403-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S403_4

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2P433 Modeling the emergence of cliques in the protein interaction networks(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Takeshi Hase, Yoshihito Niimura, Soichi Ogishima, Tuguchika Kaminuma, ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S404-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S404_1

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2P434 Emergence of protein-protein interfaces : Insight from amino acid substitutions(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Hafumi Nishi, Motonori Ota

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S404-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S404_2

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2P435 Exploring the minimal pathway maps(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Yusuke Azuma, Motonori Ota

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S404-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S404_3

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2P436 Feature finding of cis regulatory elements by mutual entropy measurement(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Mutsuko Nishihama, Wataru Matsubayashi, Satoru Miyazaki

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S404-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S404_4

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2P437 An improved thermodynamical model of hybridization on high-density oligonucleotide microarrays(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Naoaki ONO, Shingo SUZUKI, Akiko KASHIWAGI, Chikara FURUSAWA, Tetsuya ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S405-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S405_1

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2P438 Strategy to evaluate the effect of individual E. coli protein on the protein translation machinery(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Jiro Adachi, Yasuaki Kazuta, Tomoaki Matsuura, Itaru Urabe, Tetsuya Yo ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S405-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S405_2

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2P439 Proteomic analysis of yeast ribosomal protein S10 mutant(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Youn Jin Park, Yongbhum Song, Won-Ki Huh

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S405-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S405_3

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2P440 Identification of the proteins involved in production of magnetosome in Magnetospirillum magnetotacticum MS-1(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Tsubasa Kuroki, Shingo Watanabe, Ken Sawada, Tatsuo Iwasa

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S405-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S405_4

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2P441 Use of Proteomics and Cytomics to Analyze the Cell-cycle Regulation of Model Organisms(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Wei-Chen Liao

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S406-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S406_1

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2P442 RefDIC : Construction of an open-access database of the quantitative transcriptome and proteome data of immune cells(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Atsushi Hijikata, Hiroshi Kitamura, Yayoi Kimura, Ryo Yokoyama, RCAI ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S406-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S406_2

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2P443 Renal cell carcinoma proteomics by agarose two-dimensional gel electrophoresis and LC-MS/MS(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Yoshihito Nii, Hiroshi Okusa, Kazumasa Matsumoto, Masatsugu Iwamura, S ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S406-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S406_3

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2P444 Disease Peptidomics(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Yusuke Kawashima, Yoshio Kodera, Toshiyuki Fukutomi, Hiroki Takahashi, ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S406-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S406_4

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2P445 High-molecular-mass proteome analysis of prostate cancer by agarose 2-DE and LC-MS/MS(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Masamichi Oh-Ishi, Hiroshi Okusa, Yoshihito Nii, Kazumasa Matsumoto, M ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S407-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S407_1

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2P446 Proteomio analysis for urine samples(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Hiroshi Okusa, Kazumasa Matsumoto, Kazunari Yoshida, Ryoujiro Kondo, K ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S407-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S407_2

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2P447 OdaibaDock : Protein-Protein docking system using a high-performance FFT algorithm on BlueGene/L(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Tatsuya Yoshikawa, Koki Tsukamoto, Yuichiro Hourai, Tadaaki Mashimo, Y ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S407-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S407_3

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2P448 Improvement to a Protein-Protein Docking Algorithm by Introducing Layers in Molecular Expression Space(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Kazuya Sumikoshi, Tohru Terada, Shugo Nakamura, Kentaro Shimizu

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S407-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S407_4

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2P449 Improvement of the method for discriminating between biological and crystal-packing contacts in protein crystals(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Yuko Tsuchiya, Kengo Kinoshita, Nobutoshi Ito, Haruki Nakamura

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S408-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S408_1

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2P450 Correlation between sequence profiles and profiles derived from local structural classifications(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Kentaro Tomii, Yoshito Sawada, Shinya Honda

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S408-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S408_2

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2P451 Database analyses of protein structural changes induced by ligand binding(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Takayuki Amemiya, Ryotaro Koike, Yuki Imamura, Sotaro Fuchigami, Mitsu ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S408-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S408_3

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2P452 Membrane protein-ligand interactions : New insights from statistical analysis and molecular modeling studies(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Xavier M. Suresh, Michael M. Gromiha, M. Suwa

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S408-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S408_4

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2P453 Predictions of DNA-binding Proteins and Transcription Factor Targets in the Yeast Genome(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Antony Ngahu, Takuya Ueno, Shandar Ahmad, Hidetoshi Kono, Akinori Sara ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S409-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S409_1

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2P454 Crystallization Experiment Support System in the Protein Research Group and RIKEN Structural Genomics/Proteomics Initiative (RSGI)(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Chie Takemoto, Ryogo Akasaka, Tomomi Uchikubo, Aya Nishino, Akiko Urus ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S409-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S409_2

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2P455 Web service of the Protein Data Bank Japan (PDBj)(48. Bioinformatics, genomics and proteomics (II),Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Takashi Kosada, Reiko Igarashi, Yumiko Kengaku, Yasuyo Morita, Kanna M ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S409-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S409_3

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2P456 The changing cell state of the transition from the predator-prey to symbiotic relationship between E. coli and D. discoideum(49. Ecology,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Kumiko Kihara, Shingo Suzuki, Akiko Kashiwagi, Itaru Urabe, Tetsuya Yo ...

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S409-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S409_4

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2P457 Hysteresis phenomena of discrete, reversible reaction networks(50. Non-equilibrium and complex system,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Takeshi Sugawara, Kunihiko Kaneko

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S410-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S410_1

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2P458 Multi-time-scale Dynamics of Networks of Threshold Elements(50. Non-equilibrium and complex system,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Eiichiro Hoshino, Kunihiko Kaneko

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S410-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S410_2

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2P459 Molecular Deficiency Induced Transitions in Catalytic Reaction Network(50. Non-equilibrium and complex system,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Akinori Awazu, Kunihiko Kaneko

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S410-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S410_3

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2P460 A new one-dimensional map which generates 1/f spectrum(50. Non-equilibrium and complex system,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Kohei Nakajima, Takashi Ikegami

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S410-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S410_4

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2P461 Subjective time derived by dynamical interaction between A- and B-series(50. Non-equilibrium and complex system,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Yukio-Pegio Gunji, Taichi Haruna, Daisuke Uragami

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S411-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S411_1

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2P462 Robot control with amoeboid cells(50. Non-equilibrium and complex system,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Soichiro Tsuda, Yukio-Pegio Gunji

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S411-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S411_2

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2P463 Lattice-Driven Cellular Automata : Computer Simulation Model of Local Semantics(50. Non-equilibrium and complex system,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Daisuke Uragami, Yukio-Pegio Gunji

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S411-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S411_3

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2P464 The new route of 1/f spectrum in modified Bernoulli map(50. Non-equilibrium and complex system,Poster Session,Abstract,Meeting Program of EABS & BSJ 2006)

Soya Shinkai, Yoji Aizawa

原稿種別: 本文
2006 年46 巻supplement2 号 p. S411-
発行日: 2006/10/01
公開日: 2017/05/01

DOIhttps://doi.org/10.2142/biophys.46.S411_4

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