腸内細菌学雑誌
Online ISSN : 1349-8363
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30 巻, 1 号
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緒　論
総　説　＜特集：腸内細菌の分類の現状―嫌気性菌および乳酸菌を中心に―＞
  • ヒトの腸内菌の分類に関する総論
    平山 和宏
    2016 年 30 巻 1 号 p. 5-15
    発行日: 2016年
    公開日: 2016/02/18
    DOIhttps://doi.org/10.11209/jim.30.5
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    我々の腸内には1000種にも及ぶといわれる非常に多様な細菌群が常在している．しかし，この腸内細菌叢を構成する菌の分類学的な位置を見てみると，その分布には大きな偏りがあることがわかる．現在，細菌（原核生物）は，ドメインArchaeaが5つの門（phylum），ドメインBacteriaが30の門に分かれているが，このうちヒトの腸内から検出されるのは，ドメインArchaeaのうちの1門とドメインBacteriaのうちの11門だけであり，なかでもドメインBacteriaのFirmicutes，Bacteroidetes，Actinobacteria，Proteobacteriaの4門だけで菌叢のほとんどを占める．腸内細菌叢は長い年月をかけて宿主であるヒトに適応し，その機能によって高度に選抜されながらヒトとともに進化してきたと考えられる．これらヒトの腸内から検出される門にどのような菌が属するのかを概説する．
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  • 乳酸菌分類の現在とビフィズス菌・乳酸菌分類小委員会が提言した新規乳酸菌種提唱のための最少基準
    平山 洋佑, 遠藤 明仁
    2016 年 30 巻 1 号 p. 17-28
    発行日: 2016年
    公開日: 2016/02/18
    DOIhttps://doi.org/10.11209/jim.30.17
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    乳酸菌はプロバイオティクスのみならず，発酵食品スターター，サイレージのスターター等，産業的に利用される場面が多いため，幅広い研究が行われている．乳酸菌分類は16S rRNA遺伝子の塩基配列に基づく系統解析が利用されて以降，大きな変化を遂げている．新菌種として提案される乳酸菌の数は増え続け，現在は35菌属300菌種以上が乳酸菌として登録されている．これらの菌種の中には従来表現性状により分類されていた時とは異なる菌属に再分類されている菌種も見られる．このような分類の急激な変化は，多くの研究者に少なからぬ混乱を生じている．そこで本総説では，現在の乳酸菌分類状況について概説する．また，2014年に国際細菌分類命名委員会のビフィズス菌・乳酸菌分類小委員会が「Bifidobacterium, Lactobacillus及びその類縁菌の新菌種提唱に推奨される最少基準」を発表したので，これについても本総説で紹介する．
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